Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms