Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Ccdc89Q9DA73 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc89Q9DA73 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms