Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cxxc1Q9CWW7 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms