Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms