Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
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PtprtQ99M80 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Veph1-201ENSMUST00000029419 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Kif26b-202ENSMUST00000161017 13749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
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PtprtQ99M80 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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PtprtQ99M80 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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PtprtQ99M80 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
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PtprtQ99M80 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
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PtprtQ99M80 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
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PtprtQ99M80 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
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