Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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Atg4aQ8C9S8 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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