Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.8 ms