Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxa13Q62424 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms