Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms