Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms