Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms