Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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VdrP48281 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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VdrP48281 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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VdrP48281 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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VdrP48281 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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