Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Hmcn2-201ENSMUST00000113532 15646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Olfr374-202ENSMUST00000210435 8718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
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