Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms