Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RhoP15409 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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