Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
P10404 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms