Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccdc180J3QNE4 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccdc180J3QNE4 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccdc180J3QNE4 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccdc180J3QNE4 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccdc180J3QNE4 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ccdc180J3QNE4 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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