Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usf3B2RUQ2 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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