Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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