Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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