Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms