Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms