Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Atg4aQ8C9S8 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Atg4aQ8C9S8 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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Atg4aQ8C9S8 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Atg4aQ8C9S8 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Atg4aQ8C9S8 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4aQ8C9S8 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Atg4aQ8C9S8 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Atg4aQ8C9S8 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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