Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Gm28047Q3US59 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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