Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Rhox4d-201ENSMUST00000115175 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm11763-201ENSMUST00000119964 312 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 F730035M05Rik-201ENSMUST00000145871 1296 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm20765-201ENSMUST00000177792 795 ntAPPRIS P2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm21312-201ENSMUST00000179258 795 ntAPPRIS P2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Rpl22l1-206ENSMUST00000194649 525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Mark4-ps-201ENSMUST00000196140 384 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 AC142407.1-201ENSMUST00000214371 494 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 n-R5s28-201ENSMUST00000082814 119 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm11739-201ENSMUST00000125269 723 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm25265-201ENSMUST00000158520 347 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms