Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
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Rps29P62274 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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Rps29P62274 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
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Rps29P62274 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
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Rps29P62274 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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Rps29P62274 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
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Rps29P62274 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
Rps29P62274 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rps29P62274 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms