Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms