Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxraP28700 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms