Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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