Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P20040 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P20040 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
P20040 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P20040 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P20040 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P20040 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms