Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

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Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc180J3QNE4 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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