Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms