Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms