Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Rabgef1Q9JM13 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Rabgef1Q9JM13 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Rabgef1Q9JM13 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Rabgef1Q9JM13 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Rabgef1Q9JM13 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Rabgef1Q9JM13 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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