Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms