Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Rnft1Q9DCN7 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Rnft1Q9DCN7 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Rnft1Q9DCN7 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Rnft1Q9DCN7 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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