Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Epg5-201ENSMUST00000044622 9672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr1278-206ENSMUST00000216229 6819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Plxna2-201ENSMUST00000027952 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms