Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms