Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Olfr374-202ENSMUST00000210435 8718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NischQ80TM9 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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