Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms