Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PatjQ63ZW7 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PatjQ63ZW7 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms