Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trafd1Q3UDK1 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trafd1Q3UDK1 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms