Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Q3U6N9 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Q3U6N9 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Q3U6N9 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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