Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms