Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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