Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Ttc39dQ0VF76 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Ttc39dQ0VF76 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Ttc39dQ0VF76 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Ttc39dQ0VF76 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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