Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H3f3aP84244 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms