Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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VdrP48281 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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VdrP48281 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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VdrP48281 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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VdrP48281 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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VdrP48281 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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VdrP48281 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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VdrP48281 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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VdrP48281 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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VdrP48281 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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VdrP48281 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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