Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PrkcaP20444 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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