Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpraP18052 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpraP18052 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms